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VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina

科学研究试剂

高通量测序文库构建试剂

药物研发试剂

  • ND608-说明书V20.1.pdf

    大小:
    2020-10-19 09:59:47
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VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina

价格:
¥
6000.0
市场价
6000.0
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货号:
ND608-01/02
数量:
-
+
库存:
1998
暂时无货
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产品详情
FAQ
组分
说明书

VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina

高效修复DNA损伤: 有效修复碱基损伤、切刻、缺口和3’端封闭等问题

建库效率高: 文库转化率和扩增产出双提升

模板兼容性广: 兼容 gDNA,FFPE DNA,cfDNA,Amplicons 等样本

完美兼容不同质量样本: DNA修复酶对不同DIN值的FFPE DNA均有极佳的表现

建库耗时短: 单个文库构建最短仅需90min

1.FFPE损伤类型以及Vazyme FFPE DNA修复混合液的修复能力

 FFPE样本损伤类型

 是否可以被FFPE DNA修复酶混合液修复

 胞嘧啶脱氨成尿嘧啶

 是

 切刻和缺口

 是

 碱基氧化

 是

 3’端封闭

 是

 DNA片段化

 否

 DNA-蛋白交联

 否

2.高效修复碱基损伤

以FFPE样本为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,使用HiSeq X10 PE150进行测序。结果显示,VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)的高效修复功能使得碱基异常突变数量显著低于同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607),性能卓越。

图1.ND608与其他公司同类型产品及ND607,碱基异常突变数量统计对比

3.建库效率高,完美兼容FFPE、gDNA等样本

(1) 高效的文库转化率

以等量的片段化DNA和FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程构建PCR-Free文库,再进行qPCR文库定量。VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)相比同类产品和Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)在文库转化率上表现更优越,确保了文库的丰富度。

图2.ND608 与其他公司同类型产品及 ND607,有效文库产出对比

(2)优越的文库扩增效率

以等量的片段化DNA和FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,用Qubit检测文库浓度。结果表明 VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)在相同的循环数下比同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)文库产量有了极大的提高;在相同产量下比其他公司同类产品所需循环数可减少2~3个cycles,从而降低了高循环数引入的扩增偏好性。

图3.ND608与其他公司同类型产品及ND607,文库产出对比

4.显著提升测序数据质量

以300 ng小鼠FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,使用HiSeq X10 PE150进行测序,测序深度3×。结果显示,VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)在测序数据质量上较同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)表现更优越。

图4.ND608与其他公司同类产品及ND607,测序数据质量分析

VAHTS® Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina®是包含FFPE DNA修复模块的Illumina®高通量测序平台文库构建试剂盒。本试剂盒可以将100 pg - 1 μg Input DNA转换成Illumina®平台专用文库。本试剂盒包含DNA损伤修复模块,能够有效修复福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)导致的DNA损伤,如胞嘧啶脱氨、切刻和缺口、碱基氧化、3’端封闭等,同时兼容普通DNA样本,不会影响正常DNA样本文库质量。通过对末端修复模块、连接模块和文库扩增模块的整体改进,使文库转化率和扩增文库产出大幅提升,广泛适用于多种样本的PCR或PCR-Free文库构建,且兼容靶向捕获流程。试剂盒中提供的所有试剂都经过了严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

组分 ND608-01 (24 rxn) ND608-02 (96 rxn)
DNA Damage Repair Enzyme 48 μl 192 μl
End Prep Buffer 240 μl 960 μl
End Prep Enzyme 120 μl 480 μl
Rapid Ligation Buffer 2 600 μl 4 × 600 μl
Rapid DNA Ligase 120 μl 480 μl
VAHTS HiFi Amplification Mix 600 μl 4 × 600 μl
PCR Primer Mix 3 for Illumina 120 μl 480 μl
Control DNA (264 bp,50 ng/μl) 10 μl 10 μl

-30 ~ -15℃保存。-20 ~ 0℃运输。 

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