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Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina

科学研究试剂

高通量测序文库构建试剂

药物研发试剂

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    TD903 v21.2.pdf

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    2021-08-09 14:43:10
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Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina

操作简便:全流程优化,磁珠提取安全高效 样本投入量低:技术革新,适用微量样本 抗体兼容性好:转座子升级,抗体亲和力高 测序质量高:扩增模块优化,数据真实可靠 信噪比高:背景远低于ChIP-Seq,重复性好 样本投入量低,信噪比高 针对不同起始量的K562 细胞(100、10,000 cells),使用TD903 进行H3K27me3 抗体的CUT&Tag实验,通过Agilent 2100 Bioanalyzer进行文库分布检测。结果显示对于不同细胞投入量(100、10,000 cells),均可构建出相似的ladder 状的文库,说明TD903 能够兼容低细胞起始量的实验。   针对不同起始量的K562 细胞(100、1,000、10,000、100,000 cells),使用TD903 进行H3K4me3 抗体的CUT&Tag 实验。结果显示不同投入量染色体图谱基本一致,100 个细胞即可提供与ChIP-Seq 结果一致的覆盖图谱。 适用性广 使用TD903 针对10,000个A549 细胞、Hela细胞和K562 细胞,进行H3K4me3 抗体的CUT&Tag 实验。结果显示TD903 适用于多种细胞系的DNA-蛋白质互作研究。 投入10,000 个K562 细胞,使用TD903 分别测试以下不同抗体:H3K4me3 (abcam#ab8580)、H3K27me3 (CST#9733S)、H3K27ac (abcam#ab4729)、RNA PoI II (abcam#ab26721) 、CTCF (CST#3418S)。结果显示TD903 适用于多种靶蛋白的DNA-蛋白质互作研究。   Hyperactive® Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台定向开发的用于研究蛋白质-DNA相互作用的试剂盒。CUT&Tag(Cleavage Under Targets & Tagmentation)技术是一种研究蛋白质-DNA相互作用的新方法,使用Protein A/G融合的转座酶,在抗体引导下精准靶向目的蛋白,并在目的位点附近进行DNA的片段化。 本试剂盒优化了实验反应体系和建库流程,与传统的ChIP-Seq相比,具有细胞投入量低、实验周期短、信噪比高、可重复性好等优势,尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。试剂盒中所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。 -30 ~ -15℃避光保存,Master Mix解冻后可于2 ~ 8℃避光条件下稳定存放6个月;≤ 0℃运输。 BOX 1:ConA Beads和DNA Extract Beads 2 ~ 8℃保存,其余组分室温(15 ~ 25℃)保存,根据不同目的地调整运输方式。 BOX 2:5% Digitonin -30 ~ -15℃保存,室温(15 ~ 25℃)下可保存1周; 其余组分-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
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cp

操作简便:全流程优化,磁珠提取安全高效

样本投入量低:技术革新,适用微量样本

抗体兼容性好:转座子升级,抗体亲和力高

测序质量高:扩增模块优化,数据真实可靠

信噪比高:背景远低于ChIP-Seq,重复性好

cp

样本投入量低,信噪比高

针对不同起始量的K562 细胞(100、10,000 cells),使用TD903 进行H3K27me3 抗体的CUT&Tag实验,通过Agilent 2100 Bioanalyzer进行文库分布检测。结果显示对于不同细胞投入量(100、10,000 cells),均可构建出相似的ladder 状的文库,说明TD903 能够兼容低细胞起始量的实验。

 

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针对不同起始量的K562 细胞(100、1,000、10,000、100,000 cells),使用TD903 进行H3K4me3 抗体的CUT&Tag 实验。结果显示不同投入量染色体图谱基本一致,100 个细胞即可提供与ChIP-Seq 结果一致的覆盖图谱。

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适用性广

使用TD903 针对10,000个A549 细胞、Hela细胞和K562 细胞,进行H3K4me3 抗体的CUT&Tag 实验。结果显示TD903 适用于多种细胞系的DNA-蛋白质互作研究。

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投入10,000 个K562 细胞,使用TD903 分别测试以下不同抗体:H3K4me3 (abcam#ab8580)、H3K27me3 (CST#9733S)、H3K27ac (abcam#ab4729)、RNA PoI II (abcam#ab26721) 、CTCF (CST#3418S)。结果显示TD903 适用于多种靶蛋白的DNA-蛋白质互作研究。

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Hyperactive® Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina是针对Illumina高通量测序平台定向开发的用于研究蛋白质-DNA相互作用的试剂盒。CUT&Tag(Cleavage Under Targets & Tagmentation)技术是一种研究蛋白质-DNA相互作用的新方法,使用Protein A/G融合的转座酶,在抗体引导下精准靶向目的蛋白,并在目的位点附近进行DNA的片段化。

本试剂盒优化了实验反应体系和建库流程,与传统的ChIP-Seq相比,具有细胞投入量低、实验周期短、信噪比高、可重复性好等优势,尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。试剂盒中所有试剂都经过严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

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BOX 1:ConA Beads和DNA Extract Beads 2 ~ 8℃保存,其余组分室温(15 ~ 25℃)保存,根据不同目的地调整运输方式。
BOX 2:5% Digitonin -30 ~ -15℃保存,室温(15 ~ 25℃)下可保存1周;
其余组分-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

关键词:
细胞
td903
抗体
投入
不同
实验
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常见问题与解决方案

Q1: CUT&Tag适用于什么物种?

CUT&Tag广泛适用于常规哺乳动物细胞的蛋白质-DNA互作研究,植物等细胞可以经过特殊的处理(破除细胞壁或者提取细胞核)来进行实验,操作可以参考CUT&RUN技术的前端处理方式。

Q2: ConA Beads主要作用是什么?

ConA Beads经过刀豆蛋白A包被,能与细胞膜/核膜上的糖蛋白结合,从而吸附细胞,使细胞处理操作可视化,同时减少在后续实验过程中细胞的损失。

Q3: CUT&Tag是不是只能用Illumina平台测序?

Vazyme #TD903提供的转座子是针对Illumina平台定向设计的,如果需要使用其他测序平台,需自行更换适配相应平台的扩增引物。

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