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单细胞转录组扩增

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单细胞转录组扩增

5000.00
货  号:
N712-01/02/03
Single Cell Full Length mRNA-Amplification Kit 模板起始量低:单个细胞或10pg Total RNA即可作为起始模板,进行高效扩增 扩增灵敏度高:使用LNA技术及精心优化的反应体系,提高低表达基因的检出量 产物完整性好:通过双端引物扩增全长cDNA,获得全转录组信息,避免了5'和3'偏好性 单个293T细胞和10 pg Total RNA分别扩增18个循环,取1 µl纯化后的cDNA扩增产物使用Agilent 2100 Bioanalyzer进行检测,扩增产物分布于400-10000 bp,文库的peak位于2000 bp 左右;无模板阴性对照无产物。 Single Cell Full Length mRNA Amplification Kit能以1-500个细胞或10 pg-10 ng总RNA为模板,以Oligo(dT) VN Primer 为逆转录引物进行cDNA的合成,并且利用逆转录酶Sc Reverse Transcriptase的Template-switching活性在cDNA的3’端添加一段接头序列,通过该接头序列进行后续PCR扩增以获得全长cDNA扩增产物。有效避免了cDNA合成过程中的3’偏好性和rRNA的污染,对获得的全长cDNA扩增产物进行测序分析可以得到基因表达差异、可变剪接、融合基因等遗传调控信息。   Single Cell Full Length mRNA Amplification Kit ,兼容样品体积可控制为2.5 μl。一般情况下,一个反应可以产生2-20 ng的cDNA扩增产物。 Box 1,-70°C储存; Box 2,-20°C储存。
5000.00
货  号:
N712-01/02/03
浏览量:
3408
关键字:
Single Cell Full Length mRNA-Amplication Kit
单细胞扩增
N712
15000.00
货  号:
N711-01/02/03
Discover-sc® WTA Kit V2 单细胞转录组测序文库构建 模板起始量低:单个细胞或10pg Total RNA即可作为起始模板,进行高效扩增 扩增灵敏度高:使用LNA技术及精心优化的反应体系,大幅度增加了低表达基因的检出量 产物完整性好:通过双端引物扩增全长cDNA,获得全转录组信息,避免了5'和3'偏好性 操作成功率大:大大减少了RNA样品的处理,从而较大限度避免了样品损失的风险,提高了操作成功率 体积兼容性广:样品兼容体积可高达5 μl,兼容不同浓度的模板进行扩增  1.模板起始量低,扩增产物cDNA完整性好 10 pg 293T细胞Total RNA用Discover-sc® WTA Kit V2进行扩增,取1 μl cDNA扩增产物用Agilent 2100 Bioanalyzer进行分析。试剂盒以Oligo dT Primer为逆转录引物,并利用Discover-sc® Reverse Transcriptase的Template-switching活性在cDNA的3’端添加一段接头序列,通过该接头序列进行后续的PCR扩增,获得全长cDNA扩增产物,同时避免了rRNA的污染。   2.文库质量分析—数据基本指标 Vazyme-1和Vazyme-2是单个293T细胞经过Discover-sc® WTA Kit V2 进行扩增,C-1和C-2是单个293T细胞经过用C公司单细胞转录组试剂盒进行扩增,取1 ng cDNA扩增产物经TruePrep® DNA Library Prep Kit V2 for Illumina构建文库。以下均为此文库数据分析。   3.基因表达总体情况分析 Discover-sc® WTA Kit V2试剂盒扩增产物检测灵敏度高,单个293T细胞检测到基因数高达15000个。   4.数据分布均一,无偏好性 左图为Vazyme-1测序片段在基因上的分布结果,右图为C-1测序片段在基因上的分布结果,数据显示Discover-sc® WTA Kit V2扩增很好的保证了基因5’和3’的覆盖。   5.表达重复相关性高 左图为Vazyme-1和Vazyme-2表达重复相关性分析,右图为C-1和C-2表达重复性相关性分析。数据结果表明表达重复相关性高于C公司。  Discover-sc® WTA Kit V2能以1-1000个细胞或10 pg-10 ng总RNA为模板,通过第一链cDNA合成及扩增,获取足够的用于序列分析的样本,从而解决了诸如单细胞等微量样本因RNA含量过低导致的无法使用常规mRNA-seq进行测序分析的技术难题。试剂盒以Oligo dT Primer为逆转录引物进行cDNA合成,并利用Discover-sc® Reverse Transcriptase的Template-switching活性在cDNA的3’端添加一段接头序列,通过该接头序列进行后续的PCR扩增,获得全长cDNA扩增产物,有效避免了cDNA合成过程中的3’偏好性和rRNA的污染。       Discover-sc® WTA Kit V2是在Discover-sc® WTA Kit基础上开发的升级版本,其检测灵敏度、体积兼容性均得到了大幅度提升,更加适合低丰度基因及低浓度模板的检测。 Box 1,-70°C储存; Box 2,-20°C储存。
15000.00
货  号:
N711-01/02/03
浏览量:
3141
关键字:
Discover-sc WTA Kit V2
n712
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