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Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

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    Ribo-off rRNA Depletion Kit ...-V21.2.pdf

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    2021-11-01 11:20:54
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Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

用于革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的rRNA去除
价格：
¥
9500.0
市场价
元
9500.0
浏览量:
3051
货号：
N407-01/02
所属分类
RNA建库模块
数量：
-
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39996
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Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)

用于革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的rRNA去除

革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA的rRNA去除；mRNA和非编码RNA分析

·  兼容绝大多数的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌

·  高达97%的rRNA去除率

·  完整保留mRNA与lncRNA

以上表格为1 μg不同的细菌Total RNA同时用Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)（Vazyme #N407）和Ribo-Zero rRNA Removal Kit (Bacteria)  （Illumina，MRZB12424）去除rRNA，并用VAHTS Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit（Vazyme #NR603）进行后续的文库构建，可以看出N407有优异的rRNA去除效率。

Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)是针对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA中去除rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始量模板为1-5 μg的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA，总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步骤，最终将rRNA（包括16 S和23 S rRNA）从总RNA中去除，保留mRNA和其它非编码RNA，可用于LncRNA等非编码RNA的分析；该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE RNA)，所得的产物适用于RNA文库及其他实验。

-20°C保存

关键词:
N407
rRNA 去除；细菌rRNA 去除；部分降解样本rRNA去除；RNA建库模块；RNA建库模块；建库模块；NGS RNA建库模块；RNA-Seq文库制备；RNA文库制备
未找到相应参数组，请于后台属性模板中添加

Q1：如果纯化产物用于文库构建，但是使用的是Nuclease-free H2O洗脱的，如何操作？

若条件允许，加入等体积2 ×Frag/Prime Buffer，之后反应体系均放大，直至做到纯化步骤，恢复体系，也可以再次使用VAHTS® RNA Clean Beads (Vazyme #N412)进行纯化，最后用Frag/Prime Buffer洗脱。

 

Q2:纯化产物可以保存多久？

纯化产物可以在-20°C保存一天，在-80°C保存一个月。

 

Q3:如果文库浓度过低，可以从哪些角度去寻找原因并如何改进?

以高质量的RNA样品为模板构建得到的文库浓度都能达到上机测序要求，如果无法提供合格的RNA样品，可尝试使用以下方法弥补：

◇起始量：提高样品起始量，最大可做到5 μg；

◇做几个重复的样品，到二链合成纯化步骤合并在一起，或做到文库扩增前合并在一起；

◇做不分选方案：94°C 8 min打断条件下RNA片段虽然偏小，但是分布会很集中，均一性也较好，有些个性化样品会出现打断不均一、某些大小的片段较多，经过PCR更明显，出现刺峰，这种情况在不分选方案中出现很少。

 

Q4:本试剂盒是否适合用于small RNA文库制备？

不适用。因为small RNA的长度仅为22 nt左右，而磁珠抓取片段最低为100 bp以上，无法有效富集到small RNA片段。

Liu Y, Fang D, Yang K, et al. Sodium dehydroacetate confers broad antibiotic tolerance by remodeling bacterial metabolism. J Hazard Mater. 2022, 432: 128645. PMID:35299107 (IF:14.224)

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