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VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina

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VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit...-V20.1.pdf

大小：

2020-10-19 09:59:47

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浏览量:

3698

VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina

包含FFPE DNA修复模块的Illumina高通量测序平台文库构建试剂盒

价格：

6000.0

市场价

元

6000.0

浏览量:

3698

货号：

ND608-01/02

所属分类

DNA建库试剂盒

数量：

库存:

3994

*具体价格咨询当地业务员

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产品详情

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说明书

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VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina

全基因组测序；全外显子或其他靶向捕获测序；扩增子测序；免疫共沉淀测序；宏基因组测序；甲基化测序

· 高效修复DNA损伤: 有效修复碱基损伤、切刻、缺口和3’端封闭等问题

· 建库效率高: 文库转化率和扩增产出双提升

· 模板兼容性广: 兼容 gDNA，FFPE DNA，cfDNA，Amplicons 等样本

· 兼容不同质量样本: DNA修复酶对不同DIN值的FFPE DNA均有优异的表现

· 建库耗时短: 单个文库构建仅需90min

1.FFPE损伤类型以及Vazyme FFPE DNA修复混合液的修复能力

FFPE样本损伤类型	是否可以被FFPE DNA修复酶混合液修复
胞嘧啶脱氨成尿嘧啶	是
切刻和缺口	是
碱基氧化	是
3’端封闭	是
DNA片段化	否
DNA-蛋白交联	否

2.高效修复碱基损伤

以FFPE样本为模板，参照各公司建库流程进行文库构建，使用HiSeq X10 PE150进行测序。结果显示，VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina（Vazyme #ND608）的高效修复功能使得碱基异常突变数量显著低于同类产品及Vazyme常规DNA建库产品（Vazyme #ND607），性能优异。

图1.ND608与其他公司同类型产品及ND607，碱基异常突变数量统计对比

3.建库效率高，兼容FFPE、gDNA等样本

（1）高效的文库转化率

以等量的片段化DNA和FFPE DNA为模板，参照各公司建库流程构建PCR-Free文库，再进行qPCR文库定量。VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina（Vazyme #ND608）相比同类产品和Vazyme常规DNA建库产品（Vazyme #ND607）在文库转化率上表现更优越，确保了文库的丰富度。

图2.ND608 与其他公司同类型产品及 ND607，有效文库产出对比

（2）优越的文库扩增效率

以等量的片段化DNA和FFPE DNA为模板，参照各公司建库流程进行文库构建，用Qubit检测文库浓度。结果表明 VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina（Vazyme #ND608）在相同的循环数下比同类产品及Vazyme常规DNA建库产品（Vazyme #ND607）文库产量有了较大的提高；在相同产量下比其他公司同类产品所需循环数可减少2~3个cycles，从而降低了高循环数引入的扩增偏好性。

图3.ND608与其他公司同类型产品及ND607，文库产出对比

4.显著提升测序数据质量

以300 ng小鼠FFPE DNA为模板，参照各公司建库流程进行文库构建，使用HiSeq X10 PE150进行测序，测序深度3×。结果显示，VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina（Vazyme #ND608）在测序数据质量上较同类产品及Vazyme常规DNA建库产品（Vazyme #ND607）表现更优越。

图4.ND608与其他公司同类产品及ND607，测序数据质量分析

VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina是包含FFPE DNA修复模块的Illumina高通量测序平台文库构建试剂盒。本试剂盒可以将100 pg - 1 μg Input DNA转换成Illumina平台专用文库。本试剂盒包含DNA损伤修复模块，能够有效修复福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)导致的DNA损伤，如胞嘧啶脱氨、切刻和缺口、碱基氧化、3’端封闭等，同时兼容普通DNA样本，不会影响正常DNA样本文库质量。通过对末端修复模块、连接模块和文库扩增模块的整体改进，使文库转化率和扩增文库产出大幅提升，广泛适用于多种样本的PCR或PCR-Free文库构建，且兼容靶向捕获流程。试剂盒中提供的所有试剂都经过了严格的质量控制和功能验证，较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。