
VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina
VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina
全基因组测序;全外显子或其他靶向捕获测序;扩增子测序;免疫共沉淀测序;宏基因组测序;甲基化测序
· 高效修复DNA损伤: 有效修复碱基损伤、切刻、缺口和3’端封闭等问题
· 建库效率高: 文库转化率和扩增产出双提升
· 模板兼容性广: 兼容 gDNA,FFPE DNA,cfDNA,Amplicons 等样本
· 兼容不同质量样本: DNA修复酶对不同DIN值的FFPE DNA均有优异的表现
· 建库耗时短: 单个文库构建仅需90min
1.FFPE损伤类型以及Vazyme FFPE DNA修复混合液的修复能力
FFPE样本损伤类型 |
是否可以被FFPE DNA修复酶混合液修复 |
胞嘧啶脱氨成尿嘧啶 |
是 |
切刻和缺口 |
是 |
碱基氧化 |
是 |
3’端封闭 |
是 |
DNA片段化 |
否 |
DNA-蛋白交联 |
否 |
2.高效修复碱基损伤
以FFPE样本为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,使用HiSeq X10 PE150进行测序。结果显示,VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)的高效修复功能使得碱基异常突变数量显著低于同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607),性能优异。
图1.ND608与其他公司同类型产品及ND607,碱基异常突变数量统计对比
3.建库效率高,兼容FFPE、gDNA等样本
(1) 高效的文库转化率
以等量的片段化DNA和FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程构建PCR-Free文库,再进行qPCR文库定量。VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)相比同类产品和Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)在文库转化率上表现更优越,确保了文库的丰富度。
图2.ND608 与其他公司同类型产品及 ND607,有效文库产出对比
(2)优越的文库扩增效率
以等量的片段化DNA和FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,用Qubit检测文库浓度。结果表明 VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)在相同的循环数下比同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)文库产量有了较大的提高;在相同产量下比其他公司同类产品所需循环数可减少2~3个cycles,从而降低了高循环数引入的扩增偏好性。
图3.ND608与其他公司同类型产品及ND607,文库产出对比
4.显著提升测序数据质量
以300 ng小鼠FFPE DNA为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,使用HiSeq X10 PE150进行测序,测序深度3×。结果显示,VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #ND608)在测序数据质量上较同类产品及Vazyme常规DNA建库产品(Vazyme #ND607)表现更优越。
图4.ND608与其他公司同类产品及ND607,测序数据质量分析
VAHTS Universal Pro DNA Library Prep Kit for Illumina是包含FFPE DNA修复模块的Illumina高通量测序平台文库构建试剂盒。本试剂盒可以将100 pg - 1 μg Input DNA转换成Illumina平台专用文库。本试剂盒包含DNA损伤修复模块,能够有效修复福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)导致的DNA损伤,如胞嘧啶脱氨、切刻和缺口、碱基氧化、3’端封闭等,同时兼容普通DNA样本,不会影响正常DNA样本文库质量。通过对末端修复模块、连接模块和文库扩增模块的整体改进,使文库转化率和扩增文库产出大幅提升,广泛适用于多种样本的PCR或PCR-Free文库构建,且兼容靶向捕获流程。试剂盒中提供的所有试剂都经过了严格的质量控制和功能验证,较大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。
-30 ~ -15℃保存。-20 ~ 0℃运输。

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