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VAHTS Dual UMI UDI Adapters Set 1 – Set 4...-V22.1.pdf
大小：2022-02-11 16:33:41
VAHTS Dual UMI UDI Adapters Set 1 – Set 4 for Illumina
VAHTS Dual UMI UDI Adapters Set 1 – Set 4 for Illumina
低频突变检测利器
Illumina 平台DNA文库构建
· 检测低至0.1%低频突变：助力低频突变检测，配合深度测序，有效挖掘低频突变信息
· 降低标签跳跃和错配：双端唯一配对UDI，降低标签错配
1. 检测低至0.1%低频突变：
以肿瘤SNV 0.1% ctDNA标准品（含11个已知的突变位点）为模板，使用N351-N354和I*公司同类产品进行建库，捕获后上机测序，下机数据质量与I*公司同类产品相当。使用GATK4和Vardict两款软件进行低频突变分析，对0.1%低频突变的检出优于I*公司同类产品。
图1. 下机数据质量及0.1%低频突变检出
2. 基于测序的交叉污染质控
N351-N354接头在出厂时均进行了基于测序的严格质控，避免交叉污染。使用单一片段建库后进行测序，UDI标签与单一片段连接的正确率可以达到99.99%，相对于单端接头标签错配率大大降低。
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单端接头
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N351-N352
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N353-N354
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图2. 基于测序的交叉污染质控
VAHTS Dual UMI UDI Adapters Set 1 - Set 4 for Illumina是适配于Illumina高通量测序平台的DNA文库构建试剂盒。试剂盒中VAHTS Dual UMI Adapters for Illumina为不完整的双端UMI-Y型接头，可兼容多种A-T连接的文库构建试剂盒。在接头连接后，Insert DNA两端分别添加上5 - 6 nt的Unique Molecular Identifier(UMI)，可用于检测低频突变。此外，试剂盒中的VAHTS UDI Primer for Illumina包含特异性搭配的Unique Dual Index(UDI)，经文库扩增后，可实现两个完全独立Index双重检验，较大限度降低标签跳跃和错配(Index hopping & Index misassignment)，从而保证进入分析流程的reads接近样品的真实情况。
本套试剂盒由Set 1 - Set 4组成，每个Set中均包含24种不同VAHTS UDI Primer for Illumina以及 VAHTS Dual UMI Adapters for Illumina。
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组分 |
N351(96 rxns) |
N352(96 rxns) |
N353(96 rxns) |
N354(96 rxns) |
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VAHTS UDI Primer for Illumina(UDI 001 - UDI 024)
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20 μl/each |
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VAHTS UDI Primer for Illumina(UDI 025 - UDI 048)
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20 μl/each |
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VAHTS UDI Primer for Illumina(UDI 049 - UDI 072)
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20 μl/each |
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VAHTS UDI Primer for Illumina(UDI 073 - UDI 096)
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20 μl/each |
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VAHTS Dual UMI Adaptersfor Illumina
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480 μl |
480 μl |
480 μl |
480 μl |
单个DNA文库DNA Adapter使用量依据起始模板投入量而定，具体使用浓度可参考附录。
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