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TruePrep Flexible DNA Library Prep Kit for Illumina

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TruePrep Flexible DNA Library Prep Kit for Illumina

TruePrep® Flexible DNA Library Prep Kit for Illumina 建库耗时短:快速的建库流程,仅需1.3 h; 广泛的兼容性:兼容投入量100 pg - 500 ng;兼容不同物种基因组; 下机数据质量优:下机数据覆盖度高、均一性好; 1. 宽广的起始投入量兼容性(100 pg - 500 ng) 以不同投入量的基因组DNA为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,使用Qubit检测文库浓度。结果显示:相比同类产品,Vazyme #TD504文库产量更高,且平均文库大小与同类产品一致。   图1. TD504与其他公司同类型产品文库产量与平均文库大小对比   2. 物种兼容性 以不同物种基因组DNA为模板进行文库构建,参照各公司建库流程进行文库构建,使用Qubit检测文库浓度。结果显示:针对不同物种Vazyme #TD504均能实现高效建库,相比同类产品,文库产量更高。   图2. 不同投入量下平均文库大小   3. 优异的测序数据质量 以不同物种基因组 DNA 为模板,分别使用 Vazyme #TD504 和其他公司同类产品进行建库,文库质控合格后,使用 HiSeq X-TEN/Novaseq 6000 进行 PE150 测序。测序结果显示,以不同物种为模板, Vazyme #TD504 相比同类产品,测序数据质量优、均一性好。 图3. 不同物种下机数据质量   均一性: TD504(50 ng 拟南芥gDNA)   I*(50 ng拟南芥gDNA)     图4. 拟南芥下机数据均一性   4. 高效的微生物检出率: 建立一个微生物检出模型:1 ng 293 细胞 gDNA 中分别加入 10 pg(1/100)、1 pg(1/1000)、100 fg(1/10000)的E.coli gDNA和λDNA,下机数据截取相同数据量后,与其他公司同类产品进行比较,Vazyme #TD504在三组模型中的Mapped reads数均高于其他公司同类产品。在E.coli gDNA和λDNA只占1/10000时,Vazyme #TD504仍有较高的Mapped reads数。    图5. 不同微生物模型Mapped reads BOX 1,TNB 2~8℃保存,其余组分室温保存,根据不同目的地调整运输方式。 BOX 2,-30 ~ -15℃保存,≤ 0℃运输。
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TruePrep® Flexible DNA Library Prep Kit for Illumina

建库耗时短:快速的建库流程,仅需1.3 h;

广泛的兼容性:兼容投入量100 pg - 500 ng;兼容不同物种基因组;

下机数据质量优:下机数据覆盖度高、均一性好;

1. 宽广的起始投入量兼容性(100 pg - 500 ng)

以不同投入量的基因组DNA为模板,参照各公司建库流程进行文库构建,使用Qubit检测文库浓度。结果显示:相比同类产品,Vazyme #TD504文库产量更高,且平均文库大小与同类产品一致。

 

图1. TD504与其他公司同类型产品文库产量与平均文库大小对比

 

2. 物种兼容性

以不同物种基因组DNA为模板进行文库构建,参照各公司建库流程进行文库构建,使用Qubit检测文库浓度。结果显示:针对不同物种Vazyme #TD504均能实现高效建库,相比同类产品,文库产量更高。

 

图2. 不同投入量下平均文库大小

 

3. 优异的测序数据质量

以不同物种基因组 DNA 为模板,分别使用 Vazyme #TD504 和其他公司同类产品进行建库,文库质控合格后,使用 HiSeq X-TEN/Novaseq 6000 进行 PE150 测序。测序结果显示,以不同物种为模板, Vazyme #TD504 相比同类产品,测序数据质量优、均一性好。

图3. 不同物种下机数据质量

 

均一性:

TD504(50 ng 拟南芥gDNA)

 

I*(50 ng拟南芥gDNA)

 

 

图4. 拟南芥下机数据均一性

 

4. 高效的微生物检出率:

建立一个微生物检出模型:1 ng 293 细胞 gDNA 中分别加入 10 pg(1/100)、1 pg(1/1000)、100 fg(1/10000)的E.coli gDNA和λDNA,下机数据截取相同数据量后,与其他公司同类产品进行比较,Vazyme #TD504在三组模型中的Mapped reads数均高于其他公司同类产品。在E.coli gDNA和λDNA只占1/10000时,Vazyme #TD504仍有较高的Mapped reads数。

 

 图5. 不同微生物模型Mapped reads

BOX 1,TNB 2~8℃保存,其余组分室温保存,根据不同目的地调整运输方式。
BOX 2,-30 ~ -15℃保存,≤ 0℃运输。

关键词:
illumina
文库
不同
td504
同类产品
物种
数据
dna
vazyme
进行
未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

1. 使用该试剂盒是否需要对DNA进行精确定量?

不需要。TruePrep Flexible DNA Library Prep Kit for Illumina将转座酶偶联到磁珠上,从而显著提升了DNA模板投入量的兼容性,可以将100 pg - 500 ng DNA模板制备成Illumina高通量测序平台专用的测序文库。

 

2. 是否适用于PCR产物建库?

可以,但应保证其长度>100 bp。因转座酶无法作用于DNA末端,所以PCR产物末端50 bp测序覆盖度会有所降低,推荐在制备PCR产物时将待测区域两端各延长50 - 100 bp。


3. 组分TNB能否冻存?

不能。强烈建议将TNB置于2 ~ 8℃保存。


4. 使用TWB漂洗磁珠时,能否始终保持在磁力架上不进行重悬?

不推荐。不重悬漂洗可能会导致最终的文库产量比预期低。


5. 扩增后的PCR产物带有磁珠,能否使用转移的上清进行纯化或分选?

可以。该操作对文库产量及峰型无显著影响。


6. TruePrep系列能提供多少index组合?

最多提供384种index组合。其中TruePrep Index Kit V2 for Illumina(Vazyme #TD202)包含8种N5XX和12种N7XX,可提供96种index组合;TruePrep Index Kit V3 for Illumina(Vazyme #TD203)包含16种N6XX以及24种N8XX,可提供384种index组合。

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