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VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina V2

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    2021-07-16 16:56:09
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VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina V2

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6400.0
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货号:
ND627-01/02
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-
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VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina V2

PCR、PCR-Free文库构建;全基因组测序;全外显子或其他靶向捕获测序;宏基因组测序;甲基化测序;肿瘤检测

·  降低“假阳性”:  SNV和InDel检出的假阳性大大降低,提高突变检出的准确性

1. 文库转化率高
以鲑鱼基因组DNA为模板构建PCR-Free文库,投入量1 ng、1 μg,Vazyme #ND627与其他公司同类产品相比,文库转化率基本一致。

图1. 1 ng、1μg投入量下文库转化率

2. 下机数据质量好
以标准品为模板,分别使用外显子捕获panel、NCC肿瘤panel、肺癌panel进行捕获,下机基本数据表现良好。


 

图2. 下机基本数据

 

Clean GC、Q30、Mapping Rate、Dup Rate方面,Vazyme #ND627与其他公司产品无显著差异。
使用外显子捕获panel构建的文库下机数据截取22M clean reads,使用NCC肿瘤panel构建的文库下机数据截取17M clean reads,使用肺癌panel 构建的文库下机数据截取1M clean reads。靶标区域平均深度及覆盖度方面,Vazyme #ND627略优于其他公司产品及Vazyme #ND607。


3. 假阳性检出率低

图3. Softclip和Invert Chimera检出率

 

Vazyme #ND627在Softclip和Invert Chimera检出方面,与K*公司产品无明显差异,且低于其他公司同类产品。


图4. Variant检出

 

Vazyme #ND627在总Variant检出数无显著差异的情况下,大大降低了假阳性Variant的检出。

 

4.SNP和InDel检出

图5. SNP和InDel检出

综合SNP和InDel检出的灵敏度和准确性进行F-Measure打分,Vazyme #ND627在SNP和InDel检出略优于其他公司产品。

-30 ~ -15℃保存, ≤0℃运输。

关键词:
panel
nd627
ND627
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