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VAHTS Universal Plus DNA Library Prep-V21.1.pdf
大小：2021-07-16 16:56:09
VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina V2
VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina V2
PCR、PCR-Free文库构建；全基因组测序；全外显子或其他靶向捕获测序；宏基因组测序；甲基化测序；肿瘤检测
· 降低“假阳性”: SNV和InDel检出的假阳性大大降低，提高突变检出的准确性。
1. 文库转化率高
以鲑鱼基因组DNA为模板构建PCR-Free文库，投入量1 ng、1 μg，Vazyme #ND627与其他公司同类产品相比，文库转化率基本一致。
图1. 1 ng、1μg投入量下文库转化率
2. 下机数据质量好
以标准品为模板，分别使用外显子捕获panel、NCC肿瘤panel、肺癌panel进行捕获，下机基本数据表现良好。
图2. 下机基本数据
Clean GC、Q30、Mapping Rate、Dup Rate方面，Vazyme #ND627与其他公司产品无显著差异。
使用外显子捕获panel构建的文库下机数据截取22M clean reads，使用NCC肿瘤panel构建的文库下机数据截取17M clean reads，使用肺癌panel 构建的文库下机数据截取1M clean reads。靶标区域平均深度及覆盖度方面，Vazyme #ND627略优于其他公司产品及Vazyme #ND607。
3. 假阳性检出率低
图3. Softclip和Invert Chimera检出率
Vazyme #ND627在Softclip和Invert Chimera检出方面，与K*公司产品无明显差异，且低于其他公司同类产品。
图4. Variant检出
Vazyme #ND627在总Variant检出数无显著差异的情况下，大大降低了假阳性Variant的检出。
4.SNP和InDel检出
图5. SNP和InDel检出
综合SNP和InDel检出的灵敏度和准确性进行F-Measure打分，Vazyme #ND627在SNP和InDel检出略优于其他公司产品。
-30 ~ -15℃保存， ≤0℃运输。
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