
VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina V2
VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for Illumina V2
PCR、PCR-Free文库构建;全基因组测序;全外显子或其他靶向捕获测序;宏基因组测序;甲基化测序;肿瘤检测
· 降低“假阳性”: SNV和InDel检出的假阳性大大降低,提高突变检出的准确性。
1. 文库转化率高
以鲑鱼基因组DNA为模板构建PCR-Free文库,投入量1 ng、1 μg,Vazyme #ND627与其他公司同类产品相比,文库转化率基本一致。
图1. 1 ng、1μg投入量下文库转化率
2. 下机数据质量好
以标准品为模板,分别使用外显子捕获panel、NCC肿瘤panel、肺癌panel进行捕获,下机基本数据表现良好。
图2. 下机基本数据
Clean GC、Q30、Mapping Rate、Dup Rate方面,Vazyme #ND627与其他公司产品无显著差异。
使用外显子捕获panel构建的文库下机数据截取22M clean reads,使用NCC肿瘤panel构建的文库下机数据截取17M clean reads,使用肺癌panel 构建的文库下机数据截取1M clean reads。靶标区域平均深度及覆盖度方面,Vazyme #ND627略优于其他公司产品及Vazyme #ND607。
3. 假阳性检出率低
图3. Softclip和Invert Chimera检出率
Vazyme #ND627在Softclip和Invert Chimera检出方面,与K*公司产品无明显差异,且低于其他公司同类产品。
图4. Variant检出
Vazyme #ND627在总Variant检出数无显著差异的情况下,大大降低了假阳性Variant的检出。
4.SNP和InDel检出
图5. SNP和InDel检出
综合SNP和InDel检出的灵敏度和准确性进行F-Measure打分,Vazyme #ND627在SNP和InDel检出略优于其他公司产品。
-30 ~ -15℃保存, ≤0℃运输。

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