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VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2

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    2021-10-20 16:11:00
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VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2

VAHTS® Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2 适配华大平台,降低“假阳性”,提高突变检出精确率 降低“假阳性” : SNV和InDel检出的假阳性大大降低,提高突变检出的精确率。 VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2是针对MGI高通量测序平台定向开发的片段化酶法DNA文库构建试剂盒。本试剂盒针对原有版本进行了优化升级,在保持原有高性能的基础上显著降低了FFPE样本DNA文库中的Artificial Invert Chimera Reads比例,提高了SNV等检出的可靠性。本试剂盒将DNA片段化、末端修复以及末端加dA尾合并为一步,产物无需纯化,直接进行接头连接、文库富集和分选,可将100 pg - 1 μg模板DNA转换成MGI高通量测序平台专用文库。本试剂盒可完美兼容不同来源和不同投入量的DNA,仅需根据目标插入片段大小调整片段化时间,即可得到所需片段大小文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过了严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。 1. 文库产量高 以鲑鱼基因组DNA为起始模板进行文库构建,投入量分别为100 pg、1 ng、100 ng、1 μg。Vazyme #NDM627与其他公司同类产品相比,文库产量基本一致 图1. 100 pg-1 μg投入量下文库产量   2. 下机数据质量好 以NA12878、FFPE样本为模板,使用外显子捕获panel(34 Mb)进行捕获,下机基本数据表现良好。 图2. 下机数据 使用外显子捕获panel构建的文库下机数据截取64.8M clean reads进行后续生信分析。Vazyme #NDM627在下机基本数据方面与其他公司产品无显著差异,Dup Rate低于其他公司产品。   3. 假阳性检出率低 图3. Soft Clip和Invert Chimera检出 Vazyme #NDM627在Soft Clip和Invert Chimera检出方面,优于部分公司同类产品,与Vazyme #NDM607基本一致。 图4. Variant检出   Vazyme #NDM627使用外显子捕获panel检出的经VEP Filter过滤后、确定为假阳的Variant数目与其他公司同类产品一致。 图5. SNP和InDel检出 以NA12878为模板,综合SNP和InDel检出的灵敏度(Sensitivity)和精确率(Precision)进行F-Measure打分,Vazyme #NDM627在SNP和InDel检出方面与其他公司同类产品一致。 -30 ~ -15℃保存, ≤0℃运输。
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说明书

VAHTS® Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2

适配华大平台,降低“假阳性”,提高突变检出精确率

降低“假阳性” : SNV和InDel检出的假阳性大大降低,提高突变检出的精确率。

VAHTS Universal Plus DNA Library Prep Kit for MGI V2是针对MGI高通量测序平台定向开发的片段化酶法DNA文库构建试剂盒。本试剂盒针对原有版本进行了优化升级,在保持原有高性能的基础上显著降低了FFPE样本DNA文库中的Artificial Invert Chimera Reads比例,提高了SNV等检出的可靠性。本试剂盒将DNA片段化、末端修复以及末端加dA尾合并为一步,产物无需纯化,直接进行接头连接、文库富集和分选,可将100 pg - 1 μg模板DNA转换成MGI高通量测序平台专用文库。本试剂盒可完美兼容不同来源和不同投入量的DNA,仅需根据目标插入片段大小调整片段化时间,即可得到所需片段大小文库。试剂盒中提供的所有试剂都经过了严格的质量控制和功能验证,最大程度上保证了文库构建的稳定性和重复性。

1. 文库产量高

以鲑鱼基因组DNA为起始模板进行文库构建,投入量分别为100 pg、1 ng、100 ng、1 μg。Vazyme #NDM627与其他公司同类产品相比,文库产量基本一致

图1. 100 pg-1 μg投入量下文库产量

 

2. 下机数据质量好

以NA12878、FFPE样本为模板,使用外显子捕获panel(34 Mb)进行捕获,下机基本数据表现良好。

图2. 下机数据

使用外显子捕获panel构建的文库下机数据截取64.8M clean reads进行后续生信分析。Vazyme #NDM627在下机基本数据方面与其他公司产品无显著差异,Dup Rate低于其他公司产品。

 

3. 假阳性检出率低

图3. Soft Clip和Invert Chimera检出

Vazyme #NDM627在Soft Clip和Invert Chimera检出方面,优于部分公司同类产品,与Vazyme #NDM607基本一致。

图4. Variant检出

 

Vazyme #NDM627使用外显子捕获panel检出的经VEP Filter过滤后、确定为假阳的Variant数目与其他公司同类产品一致。

图5. SNP和InDel检出

以NA12878为模板,综合SNP和InDel检出的灵敏度(Sensitivity)和精确率(Precision)进行F-Measure打分,Vazyme #NDM627在SNP和InDel检出方面与其他公司同类产品一致。

-30 ~ -15℃保存, ≤0℃运输。

关键词:
vahts
检出
文库
dna
公司
vazyme
片段
ndm627
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