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Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

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    2022-11-18 17:49:56
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Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

快速:操作简便,全流程只需1 h 兼容:兼容不同物种——人、小鼠、大鼠;兼容低起始量样本——低至10 ng;兼容低质量样本——如FFPE样本 高效:rRNA去除效率高,rRNA残留率<10% Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit(Human/Mouse/Rat)适用于去除人、小鼠和大鼠总RNA中的rRNA(包括细胞质28S,18S,5S rRNA以及线粒体12S,5.8S rRNA),保留mRNA及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如lncRNA)分析。 1. 不同物种兼容性测试 以293 total RNA、Mouse total RNA、Rat total RNA为起始模板,投入量为100 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。 (1)rRNA残留率 (2)基因检出 结果显示:针对不同物种,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率低于10%,具有丰富的基因检出数。   2. 不同起始量兼容性测试 以293 total RNA为起始模板,投入量分别为1 μg、100 ng、10 ng。分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。 (1)rRNA残留率 (2)基因检出 结果显示:针对不同起始量样本,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率均低于5%,具有丰富的基因检出数。   3. FFPE样本兼容性测试 以FFPE标准品为起始模板,投入量为200 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。   (1)rRNA残留率 (2)基因检出 结果显示:针对FFPE样本,Vazyme #N420的兼容性高,具有丰富的基因检出数。 BOX 1,-30~-15℃保存,0℃运输; BOX 2,2~8℃保存,根据不同目的地调整运输方式。
价格:
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货号:
N420-01/02
所属分类
RNA建库模块
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-
+
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1998
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暂时无货
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说明书
相关文献

快速:操作简便,全流程只需1 h

兼容:兼容不同物种——人、小鼠、大鼠;兼容低起始量样本——低至10 ng;兼容低质量样本——如FFPE样本

高效:rRNA去除效率高,rRNA残留率<10%

Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit(Human/Mouse/Rat)适用于去除人、小鼠和大鼠总RNA中的rRNA(包括细胞质28S,18S,5S rRNA以及线粒体12S,5.8S rRNA),保留mRNA及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如lncRNA)分析。

1. 不同物种兼容性测试

以293 total RNA、Mouse total RNA、Rat total RNA为起始模板,投入量为100 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

 

(1)rRNA残留率

(2)基因检出

结果显示:针对不同物种,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率低于10%,具有丰富的基因检出数。

 

2. 不同起始量兼容性测试

以293 total RNA为起始模板,投入量分别为1 μg、100 ng、10 ng。分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

(1)rRNA残留率

 

(2)基因检出

结果显示:针对不同起始量样本,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率均低于5%,具有丰富的基因检出数。

 

3. FFPE样本兼容性测试

以FFPE标准品为起始模板,投入量为200 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。

 

(1)rRNA残留率

(2)基因检出

结果显示:针对FFPE样本,Vazyme #N420的兼容性高,具有丰富的基因检出数。

BOX 1,-30~-15℃保存,0℃运输;

BOX 2,2~8℃保存,根据不同目的地调整运输方式。

关键词:
rrna
vazyme
进行
rna
去除
样本
残留
起始
基因
未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

纯化产物可以如何保存?

纯化产物由于浓度较低容易降解,去除rRNA的样品应尽快进行下游实验, 否则于-80 ~ -65℃保存。

 

如果纯化产物用于文库构建,但是使用的是Nuclease-free ddH2O洗脱,如何操作?

若条件允许,加入等体积的 VAHTS 2 × Frag/Prime Buffer(Vazyme #N402),之后反应 体系均放大,直至做到纯化步骤,恢复体系;也可以再次使用VAHTS RNA Clean Beads (Vazyme #N412)进行纯化,最后用1 × Frag/Prime Buffer 洗脱。

 

如果起始文库浓度过低,可以从哪些角度去寻找原因并如何改进?

rRNA去除后RNA的产量取决于起始RNA的质量,样品中rRNA的含量和使用的纯化方法。 以高质量的RNA样品为模板构建得到的文库浓度均能达到上机测序要求,如果无法提取 合格的RNA样品,可以尝试使用以下方法弥补:

① 起始量:提高样品起始量,上限1 μg;

② 做几个重复的样品,到纯化步骤后合并在一起;

③ 做不分选方案:94℃ 8 min打断条件下RNA片段虽然偏小,但是分布会集中,均一性也较好。

这是描述信息
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