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ResiDNA Precise Quantitative CHO DNA Detection Kit

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    2022-09-19 14:00:28
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ResiDNA Precise Quantitative CHO DNA Detection Kit

可准确定量生物制品中残留的CHO DNA试剂盒
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RD102-01
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ResiDNA Precise Quantitative CHO DNA Detection Kit

可准确定量生物制品中残留的CHO DNA试剂盒

CHO宿主细胞残留DNA定量检测

·  灵敏度高:检出限低至0.3 fg/μl

·  专属性强:对CHO高特异性,外源基因不影响检测

·  耐用性高:DNA的碎片化程度不会对检测结果造成影响

·  高平台:高平台值

ResiDNA Precise Quantitative CHO DNA Detection Kit是一款利用探针法定量检测CHO宿主细胞残留DNA的试剂盒,可用于检测各种生物制品及药品的中间品、半成品和成品中CHO宿主细胞残留DNA,包含CHO DNA定量参考品,浓度与国家标准品一致,具有特异性强、灵敏度高(可检测fg级)、检测快速、稳定性好及操作便捷等特点。本试剂盒可搭配ResiDNA Hunter Residual DNA Sample Preparation Kit (Vazyme #RD101)使用,用于CHO宿主细胞残留DNA的准确检测。

1. 参考品与CHO国家标准品对齐

每批次试剂盒中的CHO DNA参考品均与国家CHO DNA标准品标定,RD102试剂盒DNA参考品与国家标准品制备标曲基本无偏差,检测值偏差CV<5%。

 

红色:国家标准品,蓝色:试剂盒参考品

图1 参考品与国家CHO DNA标准品标定扩增曲线

 

2. 灵敏度高:检出限低至0.3 fg/μl

检测3 fg/μl,1 fg/μl,0.3 fg/μl,0.1 fg/μl的CHO DNA,浓度为0.3 fg/μl及以上浓度复孔的CV值<10%,即CHO DNA残留检测试剂盒的定量限可达0.3 fg/μl。

表1 定量限结果分析

 

3 fg/μl

1 fg/μl

0.3 fg/μl

Mean

29.50

31.30

32.84

SD

0.06

0.10

0.51

CV

0.19%

0.31%

1.56%

 

3. 专属性强:对CHO高特异性,外源基因不影响检测

在含有高达100 ng/μl大鼠(Rat)、人源(Human)、大肠杆菌(E.coli )基因组干扰的情况下,CHO检测性能仍不受影响。

图2 RD102特异性检测结果分析图

注:背景干扰模板浓度均为100 ng/μl;CHO DNA的浓度梯度均为3 fg/μl-300 pg/μl

 

4. 耐用性高:DNA 的碎片化程度不会对检测结果造成影响

将CHO DNA标准品,1份作为对照,剩下4份分别进行1、5、10、30 min不同时长的超声处理,获得一系列不同程度碎片化的DNA,将超声的DNA和对照分别稀释成100 fg/μl、10 fg/μl、1 fg/μl、0.1 fg/μl作为模板进行测试,qPCR结果显示DNA碎片化程度不会影响检测结果。

图3  DNA超声破碎结果分析图

左图为:超声获得不同程度碎片化的DNA胶图;右图为:超声获得的DNA qPCR CT值比对

 

5. 高平台:高平台值

优异的扩增线型,与主流品牌相比较高平台值,低浓度样本仍能有高平台。

红色:Vazyme #R102;蓝色:Supplier A;绿色:Supplier B

图4  不同品牌试剂盒参考品的扩增曲线图

注:CHO参考品的梯度范围均为3 fg/μl-300 pg/μl

-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

关键词:
RD102
宿主细胞残留DNA定量检测
宿主细胞残留DNA定量分析
核酸残留检测
核酸残留检测试剂
宿主细胞残留DNA检测
细胞残留DNA检测
DNA残留检测
qPCR
荧光定量PCR
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Q1:扩增效率偏出90% - 110%范围 

A1:(1) 如CT(NTC) - CT(SD 6)<3或CT(SD 6) - CT(SD 5)< 3.1,且计算扩增效率超过100%,提示反应体系有污染。绘制标准曲线时,应先根据CT(NTC)确定标准曲线有效CT值范围,舍弃受污染影响的CT,使用剩余的CT绘制。

(2) 不恰当的基线(Baseline)设置会增大CT(SD 1),进而影响扩增效率计算。手动调整基线(Baseline)为1 - 3循环。

(3) 移液精确度差。

 

Q2:R2 <0.99

A2:(1) 移液精确度差。

(2) 所有试剂在使用前应充分解冻并彻底混匀。

 

Q3:标曲扩增曲线分布不均一

A3:(1) C(SD 2) - CT (SD 1)<3.1,提示基线(Baseline)设置不当。手动调整基线(Baseline)为1 - 3循环。

(2) SD 1 - SD 6之间的△CT>3.6,提示扩增效率差。确认所有试剂在使用前都已充分解冻并彻底混匀;

(3) 确认所有组分浓度正确以及反应程序无误。

 

Q4:扩增曲线形状异常

A4:(1) 扩增曲线不光滑:信号太弱,经系统矫正后产生;提高模板浓度重复实验。

(2) 扩增曲线断裂或下滑:模板浓度较高,基线的终点值大于CT值。减小基线终点(CT值 - 4), 重新分析数据。

(3) 个别扩增曲线突然骤降:反应管内留有气泡。处理样本时要注意离心,进行扩增反应之前要仔细检查反应管内是否有气泡残留。

 

Q5:阴性对照出现明显扩增

A5:反应体系污染:更换新的Mix、ddH2O、引物、探针重复实验。 

 

Q6:绝对定量时标准曲线线性关系不佳

A6:参考品降解:更换新的参考品,重复实验。

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