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Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina Pro

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    2022-12-30 10:39:52
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Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina Pro

Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina Pro是针对Illumina高通量测序平台定向开发的用于研究蛋白质-DNA相互作用的试剂盒。CUT&Tag (Cleavage Under Target & Tagmentation)技术使用Protein A/G融合的转座酶,在抗体引导下精准靶向目的蛋白,并在目的位点附近进行DNA的片段化。本试剂盒优化了实验反应体系和建库流程,与传统的ChIP-Seq相比,具有细胞投入量低、实验周期短、信噪比高、可重复性好等优势,尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。
价格:
¥
8200.0
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货号:
TD904-01/02
数量:
-
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库存:
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说明书
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样本起始量更低:技术升级,兼容更低的细胞投入量

pA/G-Tnp升级:精准靶向,切割效率高,背景低

提取模块升级:提取磁珠新升级,有效回收小片段

添加DNA Spike-in:数据标准化,减少实验误差,矫正组间差异

Hyperactive Universal CUT&Tag Assay Kit for Illumina Pro是针对Illumina高通量测序平台定向开发的用于研究蛋白质-DNA相互作用的试剂盒。CUT&Tag (Cleavage Under Target & Tagmentation)技术使用Protein A/G融合的转座酶,在抗体引导下精准靶向目的蛋白,并在目的位点附近进行DNA的片段化。本试剂盒优化了实验反应体系和建库流程,与传统的ChIP-Seq相比,具有细胞投入量低、实验周期短、信噪比高、可重复性好等优势,尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。

1. 兼容低细胞投入

针对低起始量的293细胞(10、25、50、100 cells),使用TD904进行H3K4me3抗体的CUT&Tag实验,通过Agilent 2100 Bioanalyzer进行文库分布检测。结果显示,对于低细胞投入量(10、25、50、100 cells),TD904均可构建出相似的ladder状的文库,说明TD904能够兼容低细胞起始量的实验;同时,由于pA/G-Tnp 的升级,靶向切割更加精准,重复性更好;升级后的提取磁珠能够有效的回收小片段,峰型更完整。

图1. 投入10、25、50、100 cells后的文库片段分布

 

在低细胞投入下,如10个细胞,TD904仍能获得明显的TSS富集效果。

图2. TD904低细胞投入的TSS富集热图

 

IGV视图结果显示低细胞投入下也能够获得相对应的结果。

图3. TD904低细胞投入的IGV全局视图

 

图4. TD904低细胞投入的IGV位点视图

 

2. 小片段富集优势

以293细胞为样本,投入100个细胞,使用H3K4me3抗体,针对插入片段<120 bp进行分析,结果显示,插入片段<120bp的文库能够提供有效数据,TD904能够有效回收小片段,获取对应小片段信息。

图5. 插入片段<120 bp的IGV视图

 

3. 多组学结果展示

以293细胞为样本,投入100,000个细胞,进行多组学、多靶位点比对探究。结果表明:TD904获得的数据真实可靠,且信噪比较高。

图6. 多组学结果IGV对比

BOX 1: 2 ~ 8℃保存,运输方式根据目的地进行。

BOX 2:-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

关键词:
细胞
投入
片段
td904
结果
升级
igv
实验
进行
未找到相应参数组,请于后台属性模板中添加

Q1:TD904与TD903的区别是什么?可以混用吗?

A:

1. 区别:

①TD903兼容60-10w起始投入量,TD904兼容10-10w起始投入量;

②TD904采用新升级pA/G转座子与提取磁珠,可特异性回收目的片段,同时有效回收小片段;

③TD904试剂盒包含DNA Spike-in组分,可用于矫正组间差异。

2. TD904全新升级关键组分,不可与TD903混用。

 

Q2:DNA Spike-in相关问题。

A:DNA Spike-in为非必需添加组分,可根据实际情况选择是否添加。试剂盒中提供的DNA Spike-in 是大肠杆菌λDNA的一段序列,浓度为5 ng/μl,推荐添加量为1 pg/100,000细胞,现用现稀释,可根据样本中目的蛋白丰度以及细胞投入量进行调整。具体的序列信息与分析流程详见说明书。

这是描述信息
VAHTS DNA Clean Beads
1000.00
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