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    N460(单页版说明书)V23.2.pdf

    大小:
    2023-08-10 11:26:47
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FastSelect rRNA Kit (Human)

锁核酸法rRNA快速去除,助力宏转录病原检测
价格:
¥
7800.0
市场价
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浏览量:
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货号:
N460-01/02
所属分类
RNA建库模块
数量:
-
+
库存:
19998
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说明书
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FastSelect rRNA Kit (Human)

锁核酸法rRNA快速去除,助力宏转录病原检测

  • 去除人总RNA中的rRNA
  • mRNA和非编码RNA分析
  • 宏转录组检测

  • 快速:一步去除,流程仅需2min
  • 兼容:兼容1 ng - 1 µg total RNA,兼容病原样本、FFPE样本
  • 高质:高效的rRNA去除,优异的病原检出,严格的背景菌质控

FastSelect rRNA Kit (Human)适用于去除人总RNA中的rRNA(包括细胞质28S、18S、5.8S、5S rRNA,以及线粒体16S、12S rRNA),保留mRNA及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如IncRNA)分析。该试剂盒能够快速去除人总RNA中的rRNA,操作简便快速,应用于病原微生物检出领域,能够显著提高病原检出。

 

1. 兼容不同起始量

以293T total RNA为起始模板,投入量分别为1 ng、10 ng、100 ng、1 μg。使用Vazyme #N460以及友商同类产品对rRNA去除后进行建库。通过对高质量的Clean Reads进行分析,结果显示在不同投入量下,Vazyme #N460的rRNA残留率均少于Supplier A,且基因检出数优于Supplier A。说明Vazyme #N460的rRNA去除能力更高,基因检出数更加丰富。

图1. 不同起始量下rRNA残留情况

图2. 不同起始量下基因检测数

 

2. 兼容病原样本

将293T、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、PEDV按500 : 1 : 1 : 10比例模拟临床病原样本,分别以1ng、100ng的模拟样本的total RNA为起始模板,分别使用Vazyme #N460以及Supplier A同类产品进行rRNA去除后,参照Vazyme #UNR605以及Supplier A同类产品进行建库。通过对病原检出进行分析,结果显示Vazyme #N460在1ng和100ng总RNA投入量下进行模拟样本病原检测,掺入的病原均有检出,且三种病原的RPM值均优于Supplier A,显著优于未去除组的病原检出。

图1. 病原样本-1 ng投入量下的病原RPM

图2. 病原样本-100 ng投入量下的病原RPM

 

3.兼容FFPE样本

以100ng的FFPE样本的total RNA为起始模板,分别使用Vazyme #N460以及Supplier A同类产品进行rRNA去除后,参照Vazyme #UNR605以及Supplier A同类产品进行建库。通过对高质量的Clean Reads进行分析,结果显示针对FFPE样本,Vazyme #N460的rRNA残留率均少于Supplier A,且基因检出数优于Supplier A。说明Vazyme #N460对于FFPE样本的的rRNA去除能力更高,基因检出数更加丰富。 

图1. FFPE样本的rRNA残留率

图2. FFPE样本的基因检出数

组分

N460-01

N460-02

Fast rRNA Removal Mix

24 μl

96 μl

Nuclease-free ddH2O

1 ml

4×1 ml

-30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。

 

 

 

 

关键词:
N46002
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Q1:RNA样本起始量如何选择?

A1:用于RNA-Seq的样本,总RNA起始量由所使用的RNA建库试剂盒的范围决定。

 

Q2:如果文库浓度过低,可以从哪些角度去寻找原因及如何改进?

A2:1. 如果文库的产量低于其他去除方法,这通常是由该去除方法对rRNA去除效果增加引起的,这是正常的。根据测试数据,增加1 - 2个文库扩增循环数通常足以达到上机测

序要求。

2. 以高质量的RNA样本为模板构建得到的文库浓度均能达到上机测序要求,如果无法提供合格的RNA样本,可以尝试使用以下方法弥补:

①提高样本起始量,上限1 μg;

②可增加几个重复样本,纯化后合并进行扩增;

组分

N460-01

N460-02

Fast rRNA Removal Mix

24 μl

96 μl

Nuclease-free ddH2O

1 ml

4×1 ml

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