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RNA建库模块

6000.00
货  号:
N420-01/02
快速:操作简便,全流程只需1 h 兼容:兼容不同物种——人、小鼠、大鼠;兼容低起始量样本——低至10 ng;兼容低质量样本——如FFPE样本 高效:rRNA去除效率高,rRNA残留率<10% Ribo-MagOff rRNA Depletion Kit(Human/Mouse/Rat)适用于去除人、小鼠和大鼠总RNA中的rRNA(包括细胞质28S,18S,5S rRNA以及线粒体12S,5.8S rRNA),保留mRNA及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE样本),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA(例如lncRNA)分析。 1. 不同物种兼容性测试 以293 total RNA、Mouse total RNA、Rat total RNA为起始模板,投入量为100 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。 (1)rRNA残留率 (2)基因检出 结果显示:针对不同物种,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率低于10%,具有丰富的基因检出数。   2. 不同起始量兼容性测试 以293 total RNA为起始模板,投入量分别为1 μg、100 ng、10 ng。分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。 (1)rRNA残留率 (2)基因检出 结果显示:针对不同起始量样本,Vazyme #N420的兼容性高,rRNA残留率均低于5%,具有丰富的基因检出数。   3. FFPE样本兼容性测试 以FFPE标准品为起始模板,投入量为200 ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N420、Vazyme #N406进行rRNA去除。随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建,并对高质量的Clean Reads进行分析。   (1)rRNA残留率 (2)基因检出 结果显示:针对FFPE样本,Vazyme #N420的兼容性高,具有丰富的基因检出数。 BOX 1,-30~-15℃保存,0℃运输; BOX 2,2~8℃保存,根据不同目的地调整运输方式。
6000.00
货  号:
N420-01/02
浏览量:
1000
关键字:
rrna
vazyme
进行
rna
去除
样本
残留
起始
基因
9500.00
货  号:
N417-01/02
Ribo-off® rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria) 升级版革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的rRNA去除 快速与实力并存:优化体系,保证rRNA去除效率的同时流程上缩短至1h 适用范围广:物种覆盖度提升,适用物种更广泛。 Ribo-off® rRNA Depletion Kit V2 (Bacteria) 是针对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA中去除rRNA的试剂盒。总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNase I消化等步骤,将rRNA(包括16S和23S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA以及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本 (例如FFPE RNA),得到的RNA可用于mRNA和非编码RNA (例如IncRNA)分析。 1. 不同起始量模板 以枯草芽孢杆菌为起始模板,投入量为1 μg/100 ng/10ng,分别进行不去除和使用Vazyme #N417、Vazyme #N407、A公司和B公司同类产品进行rRNA去除,随后均使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行转录组文库构建。通过对高质量的Clean Reads进行分析。结果显示在不同投入量下,Vazyme #N417去除rRNA效率均优于N407及其他品牌试剂,并在10 ng低投入量下优势尤为显著。 图1. 不同起始量下rRNA去除情况   2. 物种兼容性测试 解淀粉芽孢杆菌、格式芽孢杆菌、变异链球菌等使用Vazyme #N417进行rRNA去除,随后均使用Vazyme #NR605进行转录组文库构建。通过对高质量的Clean Reads进行分析。结果显示:Vazyme #N417可兼容多物种的rRNA去除。 图2. 不同物种使用Vazyme #N417的rRNA去除情况   3. 复杂样本兼容性测试 以土壤提取RNA为测试样本为起始模板,分别进行不去除和使用Vazyme #N417、Vazyme #N407、A公司和B公司同类产品进行rRNA去除;使用Vazyme #NR605进行转录组文库构建,通过对得到高质量的Clean Reads进行分析。结果显示:Vazyme #N417 的rRNA残留率明显低于Vazyme #N407、A及B公司品牌,并且在已检出菌种上,rRNA残留率多低于其他品牌,说明Vazyme #N417能够覆盖更多菌种的rRNA去除。 *使用Silva数据库进行rRNA 残留分析,对于top 10 菌种的 rRNA残留率进行展示。 表1. 土壤样本的rRNA残留情况   4. 基因检出率 Vazyme #N417搭配使用VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)中的进行转录组文库构建。在基因检出数指标上,与Vazyme #N407和B同类产品一致,优于A同类产品,保证了丰富的基因检出数。 图3. 各品牌产品基因检测数   -30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
9500.00
货  号:
N417-01/02
浏览量:
1000
关键字:
depletion
rrna
vazyme
去除
进行
n417
使用
rna
公司
残留
12240.00
货  号:
N408-01/02
Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat) 珠蛋白(Globin) mRNA及rRNA去除试剂盒 低质量RNA样本高效去除效率 起始量低至 10 ng Ribo-off® Globin & rRNA Depletion Kit(Human/Mouse/Rat)是针对血液样本总RNA中去除珠蛋白(Globin)mRNA及rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始模板量为0.01 - 1 μg的血液总RNA,总RNA样本经过Globin mRNA和rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNase I消化等步骤,将Globin mRNA及rRNA(包括细胞质rRNA和线粒体rRNA)从总RNA中去除,保留其它mRNA以及非编码RNA,可用于LncRNA等非编码RNA的分析;本试剂盒可兼容部分降解的RNA样本,所得到的产物适用于RNA文库构建及其它实验。 1. 不同物种、不同起始量模板 以Human、Mouse 以及 Rat Blood RNA 为起始模板,分别进行不去除和使用 N408、N*公司(#E7***L)、K*公司(K***78)同类产品进行 rRNA 去除,随后均使用 VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(NR605)进行链特异性转录组文库构建。经测序分析rRNA与Globin mRNA在下机数据中的占比。评判指标:rRNA ratio≤5%+1%;Globin mRNA ratio ≤1%+0.5%。   不同起始量(Human) 不同物种(100 ng) 图1. 不同起始量、不同物种Globin mRNA及rRNA去除情况 结果表明:不同起始量(1 µg-10 ng)、不同物种的样本,N408均能高效去除目标 RNA。 2. 不同RIN值模板 以100 ng不同RIN值的Human Blood RNA为起始模板,分别进行不去除和使用N408、N*公司(#E7***L)、K*公司(K***78)和 Q*公司(3***80)同类产品进行 rRNA 去除,随后均使用 VAHTS® Universal V8 RNA-seq Library Prep Kit for Illumina(Vazyme #NR605)进行链特异性转录组文库构建。经测序分析rRNA与Globin mRNA在下机数据中的占比。 图2. 不同RIN值样本Globin mRNA及rRNA去除情况 -30 ~ -15℃保存,≤0℃运输。
12240.00
货  号:
N408-01/02
浏览量:
1000
关键字:
depletion
rrna
rna
去除
不同
globin
mrna
起始
进行
样本
10800.00
货  号:
N409-01/02
 Ribo-off® rRNA depletion kit (Plant) 植物去除rRNA试剂盒 兼容性强:能兼容多种植物物种,同时针对植物的不同部位(根、种子和叶片)也具有良好的兼容性。 rRNA残留率低:针对不同物种均能有效去除rRNA 1.低的rRNA残留率 针对不同物种,Vazyme N409均能有效去除rRNA,较大程度减少rRNA的残留导致的数据浪费,且去除效率优于illumina同类产品。 2.优异的数据质量 对下机数据过滤后得到的高质量clean reads,根据参考序列使用HISAT2软件对序列进行比对分析,得到mapping rate。Vazyme N409搭配后续的建库模块的下机数据,在Mapping rate上优于illumina。 Ribo-off® rRNA depletion kit (Plant)是针对植物根、种子和叶片总RNA中去除rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于模板起始量为1 - 5 μg的植物总RNA,总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步骤,将rRNA(包括5S、18S和25S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA和其它非编码RNA,可用于LncRNA等非编码RNA的分析;试剂盒额外提供了靶向线粒体rRNA和叶绿体rRNA的消化探针,可以高效去除多种植物种属主要的rRNA,提供信息充实的测序结果。该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本,所得的产物适用于RNA文库及其他实验。 组分 N409-01 (12 rxn) N409-02 (24 rxn) rRNA Probe (Plant) 24 μl 48 μl Probe Buffer 36 μl 72 μl RNase H Buffer 48 μl 96 μl RNase H 12 μl 24 μl DNaseⅠBuffer 348 μl 696 μl DNaseⅠ 12 μl 24 μl Nuclease-free ddH2O 1 ml 2 × 1 ml -30°C~-15°C保存
10800.00
货  号:
N409-01/02
浏览量:
1972
关键字:
depletion
rrna
rna
去除
试剂盒
植物
24
针对
物种
数据
9500.00
货  号:
N407-01/02
Ribo-off®  rRNA Depletion Kit (Bacteria) 用于革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的rRNA去除 兼容绝大多数的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌 高达97%的rRNA去除率 完整保留mRNA与lncRNA 以上表格为1 μg不同的细菌Total RNA同时用Ribo-off® rRNA Depletion Kit (Bacteria)(Vazyme #N407)和Ribo-Zero rRNA Removal Kit (Bacteria)  (Illumina,MRZB12424)去除rRNA,并用VAHTS® Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit(Vazyme #NR603)进行后续的文库构建,可以看出N407有优异的rRNA去除效率。 Ribo-off® rRNA Depletion Kit (Bacteria)是针对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA中去除rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始量模板为1-5 μg的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA,总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步骤,最终将rRNA(包括16 S和23 S rRNA)从总RNA中去除,保留mRNA和其它非编码RNA,可用于LncRNA等非编码RNA的分析;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE RNA),所得的产物适用于RNA文库及其他实验。 -20°C保存
9500.00
货  号:
N407-01/02
浏览量:
3051
关键字:
ribo-off
rrna
rna
革兰氏
去除
kit
bacteria
阴性菌
24
阳性菌
11700.00
货  号:
N406-01/02
Ribo-offrRNADepletionKit(Human/Mouse/Rat) rRNA去除试剂盒 Ribo-offTMrRNADepletionKit(H/M/R)适用于去除人、小鼠和大鼠总RNA中的rRNA(包括细胞质28S,18S, 5SrRNA以及线粒体12S,5.8S rRNA),保留mRNA以及其它非编码RNA;该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPERNA),
11700.00
货  号:
N406-01/02
浏览量:
3400
关键字:
Ribo-off rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)
rRNA去除试剂盒
N406-01/02
800.00
货  号:
N402-01
VAHTS® 2 × Frag/Prime Buffer 增加了建库流程中的灵活性和可监测性 有效保证文库质量的可靠性 本产品是针对Illumina高通量测序平台转录组文库构建定向优化的一款产品。在高温条件下,通过Mg2+作用将RNA随机打断至短片段,需配套Vazyme的VAHTS®系列RNA建库试剂盒使用。本产品适合在RNA样品已通过其他方式片段化,只需结合随机引物进行后续建库步骤时使用,也可以在打断之前对样品进行浓度检测,相比于1×Frag/Prime Buffer增加了建库流程中的灵活性和可监测性,有效保证文库质量的可靠性。 组分 N402-01 VAHTS® 2 × Frag/Prime Buffer 936 μl -20℃保存
800.00
货  号:
N402-01
浏览量:
1920
关键字:
VAHTSTM 2 × Frag/Prime Buffer
N402-01
600.00
货  号:
N401-01/02
 VAHTS® mRNA Capture Beads mRNA分离磁珠 VAHTS® mRNA Capture Beads是偶联了Oligo (dT)的1 μm顺磁性微球,适合于从纯化的总RNA中分离poly (A)+ RNA。磁性分离技术可从小体积样品中分离出完整的mRNA,避免了mRNA沉淀的步骤。整个操作过程可在一小时内完成。 4 °C保存。 其他必需材料 磁力架 Nuclease-free PCR管 适用范围 适用于将poly (A)+ RNA从0.01 - 12.5 μg完整度良好的总RNA (RIN值应≥7)中分离出来,不完整或降解的总RNA模板会导致部分poly (A)+ RNA 信息的缺失 。
600.00
货  号:
N401-01/02
浏览量:
3294
关键字:
vahts
rna
mrna
分离
poly
beads
完整
capture
适用于
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