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单细胞系列

可对低至一个细胞以及微量样本进行全基因组水平和转录组水平的扩增。

单细胞基因组扩增

5000.00
货  号:
N603-01/02
Discover-sc® Single Cell WGA Kit  样本兼容性广 :适用于动植物细胞,细菌或者卵裂球,滋养外胚胎层细胞,精子等样本 高覆盖度 :单细胞基因组扩增后可达到95%以上的覆盖度 高均一度 :可用于>1 Mb的染色体拷贝数变异分析 高保真度 :Phi29 DNA聚合酶的保真度是Taq酶的1000倍 操作简单 :单管反应,操作时间少于10 min,扩增产物无需纯化 高均一度 1. 根据分布在人16条染色体上的管家基因设计引物,以人的单个293细胞全基因组扩增产物为模板进行qPCR反应。结果显示,16对qPCR引物都能正常扩增,且检测到的CT值均在22-28之间,表明Vazyme #N603试剂盒扩增均一性好。 图1.qPCR检测结果   2. 使用Vazyme #N603试剂盒对单细胞进行基因组扩增,并使用Vazyme转座酶建库试剂盒(#TD502)构建文库。按照有效浓度及0.01X的测序深度Pooling 后进行Illumina Miniseq测序。下机数据结果显示,reads在基因组各部位分布得比较均匀,表明Vazyme #N603扩增均一性很好,可用于大片段拷贝数变异分析。 图2.全基因组拷贝数散点分布图 高覆盖度 Discover-sc® Single Cell WGA Kit使用优化的反应体系,可以实现单细胞的全基因组扩增,且基因组覆盖度可达95%以上,与Q*及Y*公司同类型产品相比,覆盖度更高,性能更优异。 图3.N603与Q*及Y*公司同类型产品,Coverage Rate对比 指数的扩增原理   图4.Phi29 DNA 聚合酶介导的 MDA 示意图   简易的操作流程 图5.操作流程示意图 Discover-sc® Single Cell WGA Kit使用基于多重链置换扩增(MDA)的等温扩增体系,启用了定向进化改造的Phi29 DNA聚合酶,具有更高的扩增效率和扩增均一性,能够在2 h内快速实现1-1000个细胞或者微量样本的全基因组无差别扩增。单细胞基因组经N603扩增后可达到95%以上的覆盖度,扩增产物大小在2 - 100 kb之间,平均产物长度大于20 kb,广泛适用于胚胎植入前染色体检测(PGS/PGD)、肿瘤细胞、干细胞、宏基因组学等研究领域。Discover-sc® Single Cell WGA Kit中所有酶和缓冲液都经过了严格的质量控制和功能验证,优化的实验体系较大程度上提升了扩增均一性,保证了稳定性和重复性。 组分 N603-01 (24 rxns) N603-02 (96 rxns) Discover-sc® WGA Enzyme Mix 48 μl 192 μl Discover-sc® WGA Master Buffer 750 μl 3 ×1 ml Buffer D 1 ml 2 ×1 ml Stop Solution 1 ml 2 ×1 ml DTT, 1M 1 ml 1 ml Cell Storage Buffer 1 ml 2 ×1 ml H2O 1 ml 2 ×1 ml -30 ~ -15℃保存,如需更长期储存请于-70℃以下存放。
5000.00
货  号:
N603-01/02
浏览量:
1924
关键字:
single
扩增
ml
基因组
覆盖
discover-sc
wga
均一
细胞
cell

单细胞转录组扩增

5000.00
货  号:
N712-01/02/03
Single Cell Full Length mRNA-Amplification Kit 模板起始量低:单个细胞或10pg Total RNA即可作为起始模板,进行高效扩增 扩增灵敏度高:使用LNA技术及精心优化的反应体系,提高低表达基因的检出量 产物完整性好:通过双端引物扩增全长cDNA,获得全转录组信息,避免了5'和3'偏好性 单个293T细胞和10 pg Total RNA分别扩增18个循环,取1 µl纯化后的cDNA扩增产物使用Agilent 2100 Bioanalyzer进行检测,扩增产物分布于400-10000 bp,文库的peak位于2000 bp 左右;无模板阴性对照无产物。 Single Cell Full Length mRNA Amplification Kit能以1-500个细胞或10 pg-10 ng总RNA为模板,以Oligo(dT) VN Primer 为逆转录引物进行cDNA的合成,并且利用逆转录酶Sc Reverse Transcriptase的Template-switching活性在cDNA的3’端添加一段接头序列,通过该接头序列进行后续PCR扩增以获得全长cDNA扩增产物。有效避免了cDNA合成过程中的3’偏好性和rRNA的污染,对获得的全长cDNA扩增产物进行测序分析可以得到基因表达差异、可变剪接、融合基因等遗传调控信息。   Single Cell Full Length mRNA Amplification Kit ,兼容样品体积可控制为2.5 μl。一般情况下,一个反应可以产生2-20 ng的cDNA扩增产物。 Box 1,-70°C储存; Box 2,-20°C储存。
5000.00
货  号:
N712-01/02/03
浏览量:
3408
关键字:
Single Cell Full Length mRNA-Amplication Kit
单细胞扩增
N712
15000.00
货  号:
N711-01/02/03
Discover-sc® WTA Kit V2 单细胞转录组测序文库构建 模板起始量低:单个细胞或10pg Total RNA即可作为起始模板,进行高效扩增 扩增灵敏度高:使用LNA技术及精心优化的反应体系,大幅度增加了低表达基因的检出量 产物完整性好:通过双端引物扩增全长cDNA,获得全转录组信息,避免了5'和3'偏好性 操作成功率大:大大减少了RNA样品的处理,从而较大限度避免了样品损失的风险,提高了操作成功率 体积兼容性广:样品兼容体积可高达5 μl,兼容不同浓度的模板进行扩增  1.模板起始量低,扩增产物cDNA完整性好 10 pg 293T细胞Total RNA用Discover-sc® WTA Kit V2进行扩增,取1 μl cDNA扩增产物用Agilent 2100 Bioanalyzer进行分析。试剂盒以Oligo dT Primer为逆转录引物,并利用Discover-sc® Reverse Transcriptase的Template-switching活性在cDNA的3’端添加一段接头序列,通过该接头序列进行后续的PCR扩增,获得全长cDNA扩增产物,同时避免了rRNA的污染。   2.文库质量分析—数据基本指标 Vazyme-1和Vazyme-2是单个293T细胞经过Discover-sc® WTA Kit V2 进行扩增,C-1和C-2是单个293T细胞经过用C公司单细胞转录组试剂盒进行扩增,取1 ng cDNA扩增产物经TruePrep® DNA Library Prep Kit V2 for Illumina构建文库。以下均为此文库数据分析。   3.基因表达总体情况分析 Discover-sc® WTA Kit V2试剂盒扩增产物检测灵敏度高,单个293T细胞检测到基因数高达15000个。   4.数据分布均一,无偏好性 左图为Vazyme-1测序片段在基因上的分布结果,右图为C-1测序片段在基因上的分布结果,数据显示Discover-sc® WTA Kit V2扩增很好的保证了基因5’和3’的覆盖。   5.表达重复相关性高 左图为Vazyme-1和Vazyme-2表达重复相关性分析,右图为C-1和C-2表达重复性相关性分析。数据结果表明表达重复相关性高于C公司。  Discover-sc® WTA Kit V2能以1-1000个细胞或10 pg-10 ng总RNA为模板,通过第一链cDNA合成及扩增,获取足够的用于序列分析的样本,从而解决了诸如单细胞等微量样本因RNA含量过低导致的无法使用常规mRNA-seq进行测序分析的技术难题。试剂盒以Oligo dT Primer为逆转录引物进行cDNA合成,并利用Discover-sc® Reverse Transcriptase的Template-switching活性在cDNA的3’端添加一段接头序列,通过该接头序列进行后续的PCR扩增,获得全长cDNA扩增产物,有效避免了cDNA合成过程中的3’偏好性和rRNA的污染。       Discover-sc® WTA Kit V2是在Discover-sc® WTA Kit基础上开发的升级版本,其检测灵敏度、体积兼容性均得到了大幅度提升,更加适合低丰度基因及低浓度模板的检测。 Box 1,-70°C储存; Box 2,-20°C储存。
15000.00
货  号:
N711-01/02/03
浏览量:
3141
关键字:
Discover-sc WTA Kit V2
n712

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